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  • 水稻完好参阅基因组发布

  • 来源:华体会hth登录页面    发布时间:2023-11-27 23:04:20
      近来,我国农业科学院深圳农业基因组研讨所联合崖州湾实验室、我国水稻研讨所、我国农科院作物科学研讨
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  近来,我国农业科学院深圳农业基因组研讨所联合崖州湾实验室、我国水稻研讨所、我国农科院作物科学研讨所和扬州大学等多个单位为水稻育种研讨供给了新的有力东西和重要大数据根底。相关研讨成果宣布在《分子植物(Molecular Plant)》上。

  水稻是重要粮食作物,其基因组拼装对水稻育种有重要意义。自2005年水稻种类“日本晴”基因组草图发布以来,水稻研讨正式跨入基因组学年代。尔后,“日本晴”参阅基因组在2013年进一步更新,大幅改进了基因组拼装成果和基因注释,成为水稻的规范参阅基因组并一向沿用至今。但是,因为其时测序和拼装技能约束,该基因组对杂乱结构区域的拼装存在缺乏,仍有多个缺口未能处理,占全长3%左右,这些缺口阻止了水稻育种的研讨进程。

  为此,研讨团队以水稻“日本晴”为资料,综合利用新一代测序技能,完成了“日本晴”参阅基因组的完好拼装,其巨细为385.7Mb,每条染色体的端粒到端粒均由一条完好接连的序列组成,碱基精确度超越99.9999%,最新的拼装新增了12.5Mb的基因组序列,首要解锁了水稻基因组中结构最为杂乱的核糖体DNA序列、着丝粒区域、杂乱转座子序列和端粒区域等,并批改了多个因为缺口导致的基因结构过错,新增了1324个蛋白编码基因注释。该研讨为水稻育种研讨奠定了重要理论根底。

  该研讨得到国家自然科学基金、广东省自然科学杰出青年基金、我国农科院青年立异专项和海南省院士立异渠道科研项目资金赞助。

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